Re: касательно преимущества НПА...
ГК применяется к "иному" праву/законодательству (семейному и пр.), если это предусмотрено тем "иным" правом.
В принципе, нормы ГК и НК почти не пересекаются. Когда надо применить 395 ст. или ее аналог ("проценты в размере 1/300 ставки рефинансирования" и пр.), в НК на это есть прямые ссылки.
Приоритет ГК над всеми законами (в гражданском праве) приписан в вводных законах "О введение в действие ...", а также в ст. 3 ГК.
Аналогичные положения есть в начальных статьях других кодексов.
Приоритет кодексов над "просто законами" (за искл. федеральных конституционных) КС признан не противоречащим Конституции.
Если есть вопрос по конкретным статьям - спросите, будет проще ответить.