Отражение в казенном учреждении начисления по объектам строительства

Добрый день. Я работаю в казенном учреждении которое занимается строительством.Мне приносят кс-2,кс-3,счет,счет-фактуру.Когда я отражала начисление по объектам строительства я документом основанием указывала счет.Мне ревизия сделала замечание и в акте указала,что документом основанием для начисления должна быть КС-2.Скажите,я как-нибудь могу оспорить данный вопрос.Буду благодарна за ссылку на нормативную базу.